L'Institution des Chartreux propose, sur son site de la Croix-Rousse, cinq filières de formation supérieure :

• Prépas Sciences politiques,
• Prépas économiques et commerciales,
• Prépas à l'expertise comptable (DCG, DSCG),
• BTS Comptabilité et gestion des organisations,
• BTS Informatique de gestion.